Joann est né à Nice, France de deux parents juifs. Son héritage juif joue un grand rôle dans ses bandes dessinées. Le dessinateur a commencé sa carrière à la maison d'édition, l'Association,avec Les Aventures d’Ossour Hyrsidoux. Il a créé ses premières bandes dessinées avec Pierre Dubois en 1996.
Il était le scénariste pour les bandes dessinées Les Potamoks et Troll. Il était le dessinateur et le scénariste avec la bande dessinée, Les Dossiers du Professeur Bell. Son style d'écriture emploie ses memoires, philosophie, et ses caractères intéressants font des apparitions dans différentes séries.
Joann a indiqué que celle-là des personnes qui l'inspirent est Marc Chagall. Je pense que c'est très chouette parce que je suis lié à Marc Chagall. Chagall est le grand-oncle à mon grand-père.
Le série de bande dessinée, Donjon, a été créé en 1998 avec Lewis Trondheim. La série a un royaume fictif avec l'abondance de l'imagination. Plusieurs de ses amis ont créé des dérivés (spin-offs) de cette série de bandes dessinées, par exemple Donjon Zénith par Christopher Blain.
Il a gagné les prix pour ses bandes dessinées avec Emmanuel Guibert, La Fille du Professeur. Il a continué à travailler avec Emmanuel sur une histoire qui parle d'un jeune garçon juif voyageant en Palestine pendant les jours du Jésus-Christ.
Il est également célèbre pour sa série même de bande dessinée de populair, Le Chat du Rabbin.
En 2003 il a édité une série de bandes dessinées, chacune avec un instrument musical sur la couverture. Les bandes dessinées sont piano, parapluie, ukulele, harmonica, et caravane.
Ce n'est pas la série traditionnelle de bandes dessinées, mais des carnets. Sfar a indiqué que les carnets sont “ des mélangeant textes manuscrits, croquis, photos, séquences de bande dessinée et même contribution d'auteurs amis, les Carnets de Joann Sfar forment désormais une sorte de bibliothèque-feuilleton unique en son genre et d'une liberté totale.”
En 2006 il a créé la série de Le Petit Vampire. Voici une version de dessin animé adaptée de la bande dessinée.